Herb Zgromadzenia Sióstr św. Jana Chrzciciela tworzy tarcza symbolizująca wiarę broniącą Instytut od zasadzek. Jest ona podzielona na dwie części, czerwoną i białą, gdyż miecz podzielił ciało św. Jana na dwoje.


Czerwona strona reprezentuje niewinną krew, która wypłynęła z ciała Jana Chrzciciela, podczas gdy biała wskazuje na czystość jego twarzy, która pozostała bez krwi w wyniku okrutnego okaleczenia.


Ze słowami „Ecce Agnus Dei” wyrytymi w złocie na zielonej wstędze otaczającej krzyżowy miecz, św. Jan ogłasza światu dobrą nowinę.


Na zewnątrz znajduje się różaniec z modlitwą Zdrowaś Maryjo z niebieskiego kamienia, symbolu pokoju i niewinności. Ojcze nasz w złocie to symbol światła, prawdy i modlitwy. CSSJB oznacza Zgromadzenie Sióstr św. Jana Chrzciciela.